Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms