Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp2Q06649 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms