Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr16c6Q05A13 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms