Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hspg2Q05793 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms