Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms