Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox12Q04890 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms