Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms