Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcr5Q04683 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcr5Q04683 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cxcr5Q04683 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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