Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RelaQ04207 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms