Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms