Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms