Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp11Q02853 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms