Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms