Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb5Q02739 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms