Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GscQ02591 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GscQ02591 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GscQ02591 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms