Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RykQ01887 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RykQ01887 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RykQ01887 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms