Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd1Q01822 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd1Q01822 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1Q01822 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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