Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms