Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pde1bQ01065 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms