Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms