Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms