Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga4Q00651 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms