Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmmrQ00547 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmmrQ00547 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms