Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfcP97953 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms