Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cited1P97769 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms