Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
rp9P97762 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
rp9P97762 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
rp9P97762 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
rp9P97762 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms