Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms