Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme1P97371 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme1P97371 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms