Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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