Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr4P70658 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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