Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms