Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms