Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms