Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms