Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms