Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms