Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms