Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpfP62307 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms