Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga11P61622 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms