Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actr1aP61164 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms