Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms