Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snap25P60879 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snap25P60879 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms