Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ActbP60710 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ActbP60710 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms