Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms