Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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