Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms