Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtnsP57757 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtnsP57757 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtnsP57757 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtnsP57757 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms