Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms