Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lim2P56563 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lim2P56563 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms