Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms